Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL1Q9NR64 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLHL1Q9NR64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLHL1Q9NR64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLHL1Q9NR64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KLHL1Q9NR64 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL1Q9NR64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL1Q9NR64 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL1Q9NR64 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms