Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-210ENST00000607632 581 ntTSL 215.2■□□□□ 0.022e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 798.5
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-202ENST00000356810 1339 ntTSL 1 (best)16■□□□□ 0.152e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-207ENST00000463361 575 ntTSL 414.56□□□□□ -0.082e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 795
UTP3Q9NQZ2 LRRC45-205ENST00000583302 1289 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-64■■■■■ 788.8
UTP3Q9NQZ2 CDK9-202ENST00000421939 702 ntTSL 328.17■■■□□ 2.11e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-219ENST00000497483 578 ntTSL 226.24■■□□□ 1.791e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.751e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.721e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.551e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.091e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-208ENST00000470965 810 ntTSL 521.23■□□□□ 0.991e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC10-216ENST00000489424 759 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CDK9-203ENST00000480353 706 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-32■■■■■ 782.6
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 213.21□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 780.5
UTP3Q9NQZ2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 780.4
UTP3Q9NQZ2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 780.4
UTP3Q9NQZ2 SLC43A3-220ENST00000532278 506 ntTSL 425.04■■□□□ 1.63e-12■■■■■ 770.1
UTP3Q9NQZ2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.133e-28■■■■■ 768.6
UTP3Q9NQZ2 MOB2-202ENST00000526462 795 ntTSL 214.27□□□□□ -0.133e-28■■■■■ 768.6
UTP3Q9NQZ2 PIGG-216ENST00000508669 584 ntTSL 219.41■□□□□ 0.72e-80■■■■■ 768.1
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.214e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 764.7
UTP3Q9NQZ2 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.042e-31■■■■■ 763.9
UTP3Q9NQZ2 APEH-210ENST00000463616 699 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 762.4
UTP3Q9NQZ2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.192e-6■■■■■ 761.3
UTP3Q9NQZ2 CENPU-205ENST00000510146 1549 ntTSL 1 (best)22.41■■□□□ 1.182e-6■■■■■ 761.3
UTP3Q9NQZ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.765e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 325.14■■□□□ 1.625e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.445e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-204ENST00000474155 728 ntTSL 323.42■■□□□ 1.345e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.275e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.265e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.225e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-201ENST00000341697 5262 ntTSL 1 (best)22.56■■□□□ 1.25e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.175e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-208ENST00000473200 698 ntTSL 221.82■■□□□ 1.085e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.085e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-202ENST00000553939 6462 ntTSL 520.95■□□□□ 0.945e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.945e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.895e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.855e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.825e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-201ENST00000444058 685 ntTSL 319.95■□□□□ 0.784e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.785e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LAMP1-203ENST00000472564 5242 ntTSL 219.83■□□□□ 0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 319.73■□□□□ 0.755e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-206ENST00000557425 582 ntTSL 219.72■□□□□ 0.755e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.695e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.685e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-203ENST00000588887 597 ntTSL 319.08■□□□□ 0.645e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.525e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 318.26■□□□□ 0.515e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-222ENST00000484526 2969 ntTSL 217.97■□□□□ 0.475e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 PLIN5-205ENST00000590350 887 ntTSL 217.27■□□□□ 0.365e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-202ENST00000368912 3697 ntTSL 1 (best)16.95■□□□□ 0.35e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-207ENST00000530502 858 ntTSL 316.07■□□□□ 0.168e-30■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-204ENST00000368914 3892 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.155e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.125e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TRIM66-204ENST00000525788 854 ntTSL 515.13■□□□□ 0.018e-30■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.165e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SEMA6C-203ENST00000368913 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)13.86□□□□□ -0.195e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.25e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ATPAF2-207ENST00000488753 796 ntTSL 313.78□□□□□ -0.24e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-221ENST00000480230 4640 ntTSL 213.31□□□□□ -0.285e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC087163.3-201ENST00000624345 700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.324e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 AC097374.1-202ENST00000582835 3329 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.55e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 ANKMY1-217ENST00000459901 3936 ntTSL 411.09□□□□□ -0.635e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-204ENST00000461107 3592 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 FAM9B-205ENST00000472522 1533 ntTSL 510.23□□□□□ -0.775e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.985e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC8.61□□□□□ -1.035e-31■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 SUPT5H-214ENST00000598786 238 ntTSL 58.59□□□□□ -1.034e-61■■■■■ 745.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.092e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-201ENST00000263864 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 VAMP8-202ENST00000409760 805 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.792e-12■■■■■ 744.3
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 315.35■□□□□ 0.053e-18■■■■■ 742.2
UTP3Q9NQZ2 AC007780.1-201ENST00000590353 719 ntTSL 49.96□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 739.1
UTP3Q9NQZ2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.694e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.234e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-201ENST00000317799 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-202ENST00000405867 1588 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.514e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 27.74□□□□□ -1.174e-71■■■■■ 729.8
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-207ENST00000565249 1165 ntTSL 220.92■□□□□ 0.948e-16■■■■■ 726.7
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-205ENST00000564281 1772 ntTSL 519.21■□□□□ 0.678e-16■■■■■ 726.7
UTP3Q9NQZ2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.558e-16■■■■■ 726.7
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