Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FSCN3Q9NQT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FSCN3Q9NQT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FSCN3Q9NQT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FSCN3Q9NQT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FSCN3Q9NQT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FSCN3Q9NQT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FSCN3Q9NQT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSCN3Q9NQT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FSCN3Q9NQT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FSCN3Q9NQT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FSCN3Q9NQT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FSCN3Q9NQT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FSCN3Q9NQT6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms