Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
RTN4Q9NQC3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RTN4Q9NQC3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RTN4Q9NQC3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RTN4Q9NQC3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
RTN4Q9NQC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
RTN4Q9NQC3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
RTN4Q9NQC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RTN4Q9NQC3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RTN4Q9NQC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RTN4Q9NQC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms