Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BRD7Q9NPI1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
BRD7Q9NPI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRD7Q9NPI1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRD7Q9NPI1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRD7Q9NPI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD7Q9NPI1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRD7Q9NPI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRD7Q9NPI1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRD7Q9NPI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BRD7Q9NPI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BRD7Q9NPI1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BRD7Q9NPI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms