Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB18Q9NP72 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB18Q9NP72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB18Q9NP72 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB18Q9NP72 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB18Q9NP72 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB18Q9NP72 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB18Q9NP72 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB18Q9NP72 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms