Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EPB41L5Q9HCM4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPB41L5Q9HCM4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EPB41L5Q9HCM4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EPB41L5Q9HCM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
EPB41L5Q9HCM4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L5Q9HCM4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L5Q9HCM4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L5Q9HCM4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EPB41L5Q9HCM4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPB41L5Q9HCM4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPB41L5Q9HCM4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EPB41L5Q9HCM4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPB41L5Q9HCM4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms