Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EBF2Q9HAK2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EBF2Q9HAK2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
EBF2Q9HAK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EBF2Q9HAK2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EBF2Q9HAK2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EBF2Q9HAK2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EBF2Q9HAK2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
EBF2Q9HAK2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
EBF2Q9HAK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
EBF2Q9HAK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms