Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COG4Q9H9E3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COG4Q9H9E3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COG4Q9H9E3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
COG4Q9H9E3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
COG4Q9H9E3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
COG4Q9H9E3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
COG4Q9H9E3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
COG4Q9H9E3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms