Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNLQ9H714 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RUBCNLQ9H714 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RUBCNLQ9H714 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RUBCNLQ9H714 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUBCNLQ9H714 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUBCNLQ9H714 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RUBCNLQ9H714 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RUBCNLQ9H714 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RUBCNLQ9H714 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUBCNLQ9H714 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUBCNLQ9H714 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUBCNLQ9H714 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms