Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Z4

RANBP3, Ran-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP3Q9H6Z4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RANBP3Q9H6Z4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RANBP3Q9H6Z4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RANBP3Q9H6Z4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RANBP3Q9H6Z4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RANBP3Q9H6Z4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RANBP3Q9H6Z4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RANBP3Q9H6Z4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.1 ms