Protein–RNA interactions for Protein: Q9H511

KLHL31, Kelch-like protein 31, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL31Q9H511 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KLHL31Q9H511 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KLHL31Q9H511 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KLHL31Q9H511 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KLHL31Q9H511 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KLHL31Q9H511 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KLHL31Q9H511 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KLHL31Q9H511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KLHL31Q9H511 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms