Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E7

DEF6, Differentially expressed in FDCP 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEF6Q9H4E7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
DEF6Q9H4E7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
DEF6Q9H4E7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DEF6Q9H4E7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DEF6Q9H4E7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
DEF6Q9H4E7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DEF6Q9H4E7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DEF6Q9H4E7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DEF6Q9H4E7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
DEF6Q9H4E7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DEF6Q9H4E7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DEF6Q9H4E7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
DEF6Q9H4E7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DEF6Q9H4E7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms