Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHMP4BQ9H444 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHMP4BQ9H444 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
CHMP4BQ9H444 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CHMP4BQ9H444 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CHMP4BQ9H444 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CHMP4BQ9H444 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CHMP4BQ9H444 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CHMP4BQ9H444 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CHMP4BQ9H444 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CHMP4BQ9H444 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CHMP4BQ9H444 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms