Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X0

CHRD, Chordin, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDQ9H2X0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CHRDQ9H2X0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CHRDQ9H2X0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CHRDQ9H2X0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CHRDQ9H2X0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CHRDQ9H2X0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRDQ9H2X0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CHRDQ9H2X0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CHRDQ9H2X0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CHRDQ9H2X0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CHRDQ9H2X0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CHRDQ9H2X0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CHRDQ9H2X0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHRDQ9H2X0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRDQ9H2X0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRDQ9H2X0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms