Protein–RNA interactions for Protein: Q9H270

VPS11, Vacuolar protein sorting-associated protein 11 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS11Q9H270 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS11Q9H270 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS11Q9H270 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS11Q9H270 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VPS11Q9H270 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VPS11Q9H270 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VPS11Q9H270 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VPS11Q9H270 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS11Q9H270 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VPS11Q9H270 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
VPS11Q9H270 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
VPS11Q9H270 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VPS11Q9H270 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS11Q9H270 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS11Q9H270 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms