Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1K6

TLNRD1, Talin rod domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLNRD1Q9H1K6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TLNRD1Q9H1K6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLNRD1Q9H1K6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TLNRD1Q9H1K6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TLNRD1Q9H1K6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TLNRD1Q9H1K6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TLNRD1Q9H1K6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TLNRD1Q9H1K6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TLNRD1Q9H1K6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TLNRD1Q9H1K6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TLNRD1Q9H1K6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TLNRD1Q9H1K6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms