Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLR1EQ9GZS1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR1EQ9GZS1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1EQ9GZS1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLR1EQ9GZS1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLR1EQ9GZS1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLR1EQ9GZS1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLR1EQ9GZS1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLR1EQ9GZS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms