Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
BCL11BQ9C0K0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
BCL11BQ9C0K0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
BCL11BQ9C0K0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
BCL11BQ9C0K0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
BCL11BQ9C0K0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
BCL11BQ9C0K0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BCL11BQ9C0K0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BCL11BQ9C0K0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
BCL11BQ9C0K0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
BCL11BQ9C0K0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
BCL11BQ9C0K0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
BCL11BQ9C0K0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms