Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FOXP3Q9BZS1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FOXP3Q9BZS1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXP3Q9BZS1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXP3Q9BZS1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXP3Q9BZS1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXP3Q9BZS1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FOXP3Q9BZS1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
FOXP3Q9BZS1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms