Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKD2Q9BZL6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKD2Q9BZL6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PRKD2Q9BZL6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRKD2Q9BZL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PRKD2Q9BZL6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PRKD2Q9BZL6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRKD2Q9BZL6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRKD2Q9BZL6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKD2Q9BZL6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKD2Q9BZL6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms