Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KRTAP9-8Q9BYQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms