Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CACNG6Q9BXT2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CACNG6Q9BXT2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CACNG6Q9BXT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CACNG6Q9BXT2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CACNG6Q9BXT2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CACNG6Q9BXT2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CACNG6Q9BXT2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms