Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C1QTNF1Q9BXJ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C1QTNF1Q9BXJ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C1QTNF1Q9BXJ1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C1QTNF1Q9BXJ1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1QTNF1Q9BXJ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1QTNF1Q9BXJ1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1QTNF1Q9BXJ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1QTNF1Q9BXJ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C1QTNF1Q9BXJ1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1QTNF1Q9BXJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms