Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GATA5Q9BWX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GATA5Q9BWX5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GATA5Q9BWX5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GATA5Q9BWX5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
GATA5Q9BWX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GATA5Q9BWX5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GATA5Q9BWX5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GATA5Q9BWX5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GATA5Q9BWX5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms