Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWL3

C1orf43, Uncharacterized protein C1orf43, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43Q9BWL3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C1orf43Q9BWL3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C1orf43Q9BWL3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C1orf43Q9BWL3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C1orf43Q9BWL3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C1orf43Q9BWL3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1orf43Q9BWL3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms