Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RBM42Q9BTD8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RBM42Q9BTD8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RBM42Q9BTD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RBM42Q9BTD8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
RBM42Q9BTD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
RBM42Q9BTD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
RBM42Q9BTD8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RBM42Q9BTD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RBM42Q9BTD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RBM42Q9BTD8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RBM42Q9BTD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RBM42Q9BTD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
RBM42Q9BTD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RBM42Q9BTD8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC35.19■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
RBM42Q9BTD8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
RBM42Q9BTD8 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
RBM42Q9BTD8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.97■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
RBM42Q9BTD8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms