Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT2

UQCC2, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC2Q9BRT2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UQCC2Q9BRT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UQCC2Q9BRT2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UQCC2Q9BRT2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UQCC2Q9BRT2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UQCC2Q9BRT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
UQCC2Q9BRT2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UQCC2Q9BRT2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms