Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CITED1Q99966 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CITED1Q99966 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CITED1Q99966 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED1Q99966 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CITED1Q99966 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CITED1Q99966 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CITED1Q99966 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CITED1Q99966 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CITED1Q99966 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CITED1Q99966 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CITED1Q99966 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CITED1Q99966 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED1Q99966 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CITED1Q99966 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CITED1Q99966 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CITED1Q99966 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CITED1Q99966 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CITED1Q99966 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CITED1Q99966 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CITED1Q99966 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CITED1Q99966 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED1Q99966 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED1Q99966 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CITED1Q99966 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CITED1Q99966 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CITED1Q99966 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms