Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RNF5Q99942 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RNF5Q99942 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF5Q99942 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF5Q99942 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RNF5Q99942 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RNF5Q99942 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RNF5Q99942 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms