Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD9AQ99638 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RAD9AQ99638 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RAD9AQ99638 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAD9AQ99638 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAD9AQ99638 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD9AQ99638 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD9AQ99638 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD9AQ99638 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RAD9AQ99638 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAD9AQ99638 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RAD9AQ99638 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
RAD9AQ99638 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms