Protein–RNA interactions for Protein: Q99593

TBX5, T-box transcription factor TBX5, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX5Q99593 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX5Q99593 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBX5Q99593 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX5Q99593 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBX5Q99593 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBX5Q99593 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBX5Q99593 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBX5Q99593 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBX5Q99593 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.02■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TBX5Q99593 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TBX5Q99593 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TBX5Q99593 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TBX5Q99593 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms