Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TCF12Q99081 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TCF12Q99081 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TCF12Q99081 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCF12Q99081 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TCF12Q99081 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TCF12Q99081 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TCF12Q99081 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCF12Q99081 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
TCF12Q99081 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TCF12Q99081 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms