Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
YME1L1Q96TA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
YME1L1Q96TA2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
YME1L1Q96TA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
YME1L1Q96TA2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
YME1L1Q96TA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
YME1L1Q96TA2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
YME1L1Q96TA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
YME1L1Q96TA2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
YME1L1Q96TA2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
YME1L1Q96TA2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
YME1L1Q96TA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
YME1L1Q96TA2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
YME1L1Q96TA2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
YME1L1Q96TA2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
YME1L1Q96TA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms