Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB8

SMC6, Structural maintenance of chromosomes protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC6Q96SB8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SMC6Q96SB8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMC6Q96SB8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMC6Q96SB8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC6Q96SB8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMC6Q96SB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMC6Q96SB8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMC6Q96SB8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC6Q96SB8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMC6Q96SB8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC6Q96SB8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms