Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
TUBGCP6Q96RT7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
TUBGCP6Q96RT7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.63■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TUBGCP6Q96RT7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
TUBGCP6Q96RT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
TUBGCP6Q96RT7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TUBGCP6Q96RT7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
TUBGCP6Q96RT7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
TUBGCP6Q96RT7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TUBGCP6Q96RT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TUBGCP6Q96RT7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
TUBGCP6Q96RT7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
TUBGCP6Q96RT7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
TUBGCP6Q96RT7 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
TUBGCP6Q96RT7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
TUBGCP6Q96RT7 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
TUBGCP6Q96RT7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TUBGCP6Q96RT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
TUBGCP6Q96RT7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TUBGCP6Q96RT7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TUBGCP6Q96RT7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TUBGCP6Q96RT7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TUBGCP6Q96RT7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TUBGCP6Q96RT7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TUBGCP6Q96RT7 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms