Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORCS2Q96PQ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SORCS2Q96PQ0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SORCS2Q96PQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SORCS2Q96PQ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SORCS2Q96PQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SORCS2Q96PQ0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SORCS2Q96PQ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.5 ms