Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RILPQ96NA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RILPQ96NA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RILPQ96NA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RILPQ96NA2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RILPQ96NA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RILPQ96NA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RILPQ96NA2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RILPQ96NA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RILPQ96NA2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms