Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC138Q96M89 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC138Q96M89 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC138Q96M89 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC138Q96M89 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC138Q96M89 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC138Q96M89 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC138Q96M89 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC138Q96M89 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC138Q96M89 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms