Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
TRIM47Q96LD4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.69
TRIM47Q96LD4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM47Q96LD4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM47Q96LD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM47Q96LD4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM47Q96LD4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM47Q96LD4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRIM47Q96LD4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRIM47Q96LD4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRIM47Q96LD4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRIM47Q96LD4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms