Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LOXL4Q96JB6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LOXL4Q96JB6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LOXL4Q96JB6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LOXL4Q96JB6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LOXL4Q96JB6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LOXL4Q96JB6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LOXL4Q96JB6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LOXL4Q96JB6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LOXL4Q96JB6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms