Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MRPL48Q96GC5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MRPL48Q96GC5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MRPL48Q96GC5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MRPL48Q96GC5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MRPL48Q96GC5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MRPL48Q96GC5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MRPL48Q96GC5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MRPL48Q96GC5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms