Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
OPTNQ96CV9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
OPTNQ96CV9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
OPTNQ96CV9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.75
OPTNQ96CV9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
OPTNQ96CV9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
OPTNQ96CV9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
OPTNQ96CV9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
OPTNQ96CV9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
OPTNQ96CV9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
OPTNQ96CV9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.78■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
OPTNQ96CV9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
OPTNQ96CV9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
OPTNQ96CV9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
OPTNQ96CV9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
OPTNQ96CV9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
OPTNQ96CV9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms