Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPRTQ96BW1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPRTQ96BW1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPRTQ96BW1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPRTQ96BW1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UPRTQ96BW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UPRTQ96BW1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UPRTQ96BW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UPRTQ96BW1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UPRTQ96BW1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UPRTQ96BW1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UPRTQ96BW1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPRTQ96BW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UPRTQ96BW1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms