Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ1

CLUAP1, Clusterin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUAP1Q96AJ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLUAP1Q96AJ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLUAP1Q96AJ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLUAP1Q96AJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLUAP1Q96AJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLUAP1Q96AJ1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLUAP1Q96AJ1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLUAP1Q96AJ1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLUAP1Q96AJ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CLUAP1Q96AJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CLUAP1Q96AJ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CLUAP1Q96AJ1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CLUAP1Q96AJ1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLUAP1Q96AJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CLUAP1Q96AJ1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CLUAP1Q96AJ1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLUAP1Q96AJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CLUAP1Q96AJ1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLUAP1Q96AJ1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CLUAP1Q96AJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CLUAP1Q96AJ1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms