Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NXPE3Q969Y0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NXPE3Q969Y0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NXPE3Q969Y0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NXPE3Q969Y0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NXPE3Q969Y0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NXPE3Q969Y0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NXPE3Q969Y0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NXPE3Q969Y0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXPE3Q969Y0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXPE3Q969Y0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NXPE3Q969Y0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NXPE3Q969Y0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NXPE3Q969Y0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NXPE3Q969Y0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NXPE3Q969Y0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms