Protein–RNA interactions for Protein: Q92766

RREB1, Ras-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RREB1Q92766 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
RREB1Q92766 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
RREB1Q92766 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RREB1Q92766 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RREB1Q92766 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RREB1Q92766 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RREB1Q92766 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RREB1Q92766 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RREB1Q92766 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RREB1Q92766 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RREB1Q92766 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RREB1Q92766 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RREB1Q92766 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
RREB1Q92766 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RREB1Q92766 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
RREB1Q92766 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
RREB1Q92766 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RREB1Q92766 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
RREB1Q92766 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
RREB1Q92766 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RREB1Q92766 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms