Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNRQ92752 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNRQ92752 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
TNRQ92752 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNRQ92752 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
TNRQ92752 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
TNRQ92752 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
TNRQ92752 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
TNRQ92752 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
TNRQ92752 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNRQ92752 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
TNRQ92752 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
TNRQ92752 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
TNRQ92752 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
TNRQ92752 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
TNRQ92752 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
TNRQ92752 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNRQ92752 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNRQ92752 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
TNRQ92752 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
TNRQ92752 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
TNRQ92752 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
TNRQ92752 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
TNRQ92752 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TNRQ92752 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
TNRQ92752 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNRQ92752 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
TNRQ92752 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
TNRQ92752 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
TNRQ92752 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
TNRQ92752 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNRQ92752 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNRQ92752 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNRQ92752 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
TNRQ92752 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNRQ92752 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
TNRQ92752 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNRQ92752 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
TNRQ92752 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
TNRQ92752 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
TNRQ92752 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
TNRQ92752 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNRQ92752 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNRQ92752 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
TNRQ92752 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
TNRQ92752 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNRQ92752 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNRQ92752 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
TNRQ92752 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
TNRQ92752 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TNRQ92752 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
TNRQ92752 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
TNRQ92752 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
TNRQ92752 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TNRQ92752 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TNRQ92752 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TNRQ92752 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.02■■■■■ 4
TNRQ92752 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.02■■■■■ 4
TNRQ92752 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TNRQ92752 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC40.01■■■■■ 4
TNRQ92752 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.01■■■■■ 4
TNRQ92752 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TNRQ92752 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TNRQ92752 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TNRQ92752 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
TNRQ92752 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNRQ92752 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TNRQ92752 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TNRQ92752 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TNRQ92752 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TNRQ92752 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TNRQ92752 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.9■■■■□ 3.98
TNRQ92752 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TNRQ92752 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TNRQ92752 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNRQ92752 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TNRQ92752 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TNRQ92752 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TNRQ92752 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNRQ92752 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TNRQ92752 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
TNRQ92752 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC39.81■■■■□ 3.96
TNRQ92752 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
TNRQ92752 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNRQ92752 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNRQ92752 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TNRQ92752 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.77■■■■□ 3.96
TNRQ92752 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TNRQ92752 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
TNRQ92752 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
TNRQ92752 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNRQ92752 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNRQ92752 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
TNRQ92752 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.71■■■■□ 3.95
TNRQ92752 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms