Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASKIN2Q8WXE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASKIN2Q8WXE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASKIN2Q8WXE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASKIN2Q8WXE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CASKIN2Q8WXE0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CASKIN2Q8WXE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CASKIN2Q8WXE0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CASKIN2Q8WXE0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CASKIN2Q8WXE0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASKIN2Q8WXE0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms