Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB3

HEXDC, Hexosaminidase D, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEXDCQ8WVB3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HEXDCQ8WVB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HEXDCQ8WVB3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HEXDCQ8WVB3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEXDCQ8WVB3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEXDCQ8WVB3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
HEXDCQ8WVB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HEXDCQ8WVB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
HEXDCQ8WVB3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HEXDCQ8WVB3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms